Az 1988-1989-es labdarúgó-bajnokságot a Honvéd nyerte a Ferencváros és az MTK előtt. Az MLSZ meg akarta szüntetni a békés döntetleneket, ezért bevezette, hogy ha 90 perc után eldöntetlen a mérkőzés, akkor az Európa Kupákból ismert módon, 55 tizenegyes rúgásával dőljön el a végeredmény. Amely csapat 90 perc alatt tudott győzni, az 3 pontot kapott, ha tizenegyesek döntöttek akkor a győztes 2 a vesztes 1 pontot kapott. A tizenegyes-bajnokság csak egy évet élt meg.

Érdekesség, hogy a Videoton - amely az egész bajnokságban a legkevesebb alkalommal győzött tizenegyespárbajban - a korábbi két- és a későbbi hárompontos rendszerben is bajnok lett volna, így viszont 4. helyen végzett.

Októberben újabb bundabotrány robbant ki. Az ügy sok válogatott játékost is érintett, ezért Máltán tartalékosan játszott VB selejtezőt a nemzeti csapat. A 2-2-es eredmény kevés volt a továbbjutáshoz. A szövetségben uralkodó fejetlenség miatt Mezey György, szövetségi kapitány az MLSZ feloszlatását követelte. Annyit sikerült elérnie, hogy tavasszal már Bicskei Bertalan lett a kapitány.